In den Rocky Mountains, nur wenige Kilometer vom Stadtkern entfernt liegt der Helena Regional Airport.
Der Flugplatz wurde bereits 1911 eröffnet und war ein wichtiger Schritt zur nationalen Anbindung der Stadt Helena und der umliegenden Dörfer, da die Region bis dahin nur sehr schwer zu erreichen war. Durch die Lage im Hochgebirge war der Flughafen lange Zeit eine Herausforderung für junge Piloten. Ab den 60er Jahren wurde der Flughafen umfassend und kontinuierlich ausgebaut und modernisiert, so dass auch größere Maschinen von hier aus starten und landen können. Zuletzt wurden die Sicherheitsvorkehrungen am Helena Regional Airport verbessert, nachdem 2004 ein Ausbau des Terminals und der Runways abgeschlossen wurde. Insgesamt verfügt der Airport über drei Start- und Landebahnen.
Neben privaten und regionalen Flügen, die auch private Flugplätze und kleine Landebahnen anfliegen, sind vor allem die Verbindungen mit großen US-amerikanischen Städten von Bedeutung. Beispielsweise nach Salt Lake City und Seattle. Einerseits wird die Bevölkerung so mit diesen Ballungsräumen verbunden und andererseits mit dem internationalen Flugverkehr. Viele Flieger gehen erst von den internationalen Flughäfen dieser Städte ab.