Um in dem Ballungsraum Tokio, der über 34 Millionen Menschen umfasst, eine adäquate Anbindung an den nationalen und internationalen Flugverkehr bieten zu können stehen zwei Flughäfen zur Verfügung: Der Haneda Airport und der Narita International Airport.
Haneda International Airport ist der ältere und auch der größere der beiden Flughäfen. Das 1931 eröffnete Gelände verfügt über vier Runways und zwei Terminals. In seiner Geschichte wurde er mehrmals modernisiert und erweitert. Momentan ist eine weitere Expansion im Gange, die das derzeitige Passagieraufkommen von fast 65 Millionen Passagieren jährlich auf 90 Millionen anheben soll. Mit dem bereits bestehenden Aufkommen gehört der Haneda International zu den fünf größten Flughäfen der Welt. Die wichtigsten Verbindungen liegen in Asien, darunter unter anderen China, Singapur, Thailand und Malaysia. Einige Ziele wie Paris und Los Angeles bieten auch eine Anbindung an Europa und Nordamerika, allerdings werden diese Flüge zunehmend vom Narita International aus durchgeführt.
Der Narita International wurde 2002 nach langen Verzögerungen eröffnet und ist damit ein sehr junger Flughafen. Von hier aus werden über 30 Millionen Passagiere abgefertigt, die, wie bereits erwähnt, vor allem aus westlichen Ländern stammen. Diese Entwicklung wird besonders durch den Ausbau der Terminals für die A380 Klasse begünstigt, so fliegt beispielsweise Lufthansa von Frankfurt am Main aus mit einem A380 nonstop. Außerdem dominiert der Narita International den Cargoverkehr Tokios gegenüber dem Haneda International. Dabei stehen zwei Runways und zwei Terminals zur Verfügung.